2017-12-21 Amy 清华细胞影像平台

前言

自从全自动数字玻片扫描系统到货以后，集万千宠爱于一身，受到众多小盆友的追捧，一时间红遍大江南北，长城内外。霎时间，机时难求，如同春运抢票一般。

为何如此一台小小的仪器在众多仪器备中脱颖而出？它背后究竟有什么鲜为人知的秘密呢？

今天，让我们一同走近全自动数字玻片扫描系统——Zeiss Axio Scan. Z1。

1. Axio Scan. Z1有内涵：25个样品夹，每个样品夹可上4片玻片，一次可装载100片样品。

2. Axio Scan. Z1尽显奢华拍照品质。同时拥有三芯片彩色CCD和科研级高速sCMOS，将明场和荧光图像一网打尽，尽收眼底。

3. Axio Scan. Z1秉承着Zeiss公司一向的低调风格，从不张扬，以沉着稳健的能力著称，没有过度的渲染和宣传，只靠实力说话。连续每月400机时的测试量，依然稳定运行，任劳任怨。

如此高端大气上档次，低调奢华有内涵有的仪器小编实在是忍不住内心的小激动，要夸赞两句！！！有好东西怎能不和大家一同分享！！！

小编在之前的帖子中提到过如何使用全自动数字玻片扫描系统获得高质量的图像（基础班），摘取主要内容如下：

Tips

1. 玻片一定要干净，否则仪器可能会将较脏区域误认为信号来进行对焦，上样前建议使用擦镜纸擦拭干净。

2. 封片剂尽量选择其折射率接近盖玻片的（n=1.52），封片剂不宜使用过多，不要溢出。

3. 在圈定样品范围时，尽量减少空白区域，避免或减少仪器在此范围选取对焦点。

4.  荧光样品，可以染上DAPI，由于其易染且信号较强，很容易帮助找到焦平面。

5. 明场样品不要染色过浅。

但是，要想要快速采集图片，还有很多的小秘密和小诀窍，下面我们进入——进阶班！！！

样品采集范围识别的准确与否，在一定程度上影响了样品的采集效率和图像质量。下面，小编来告诉大家，哪些参数的调整，可以又快又好地识别样品区~~~

在样品识别设定步骤中，我们常用到的对我们有帮助的三个参数分别是：

(1) Min region size:是为程序指定的最小样品的面积，也就是说小于这个面积的样品将不被识别，设定此值，可有效地去除一些面积小、着色较深的杂质。但是，如果样品本身面积较小时，需要降低此值，才能识别样本。

(2) Air border dilate：设定的样品与空气边界的距离，让程序知道玻片上更为居中的部分是样品，默认设定值是150，可以排除一些边缘溢出的封片剂对样品识别的干扰。当样品比较靠近边缘时，降低此值，可更为有效识别到样本。

(3) Max elongation：最大延伸率，指的是一个样品的长宽比。若样品过于细长，需要提高此值。

好了，说了这么多，小编知道，一定把很多小盆友给讲（说）清（迷）楚（糊）了。

负责的小编，只能上图，更清楚地展示参数调整及其对结果的影响。

小编用Marker笔画了三个图案，假定为自己要检测的样品。

当仪器按照默认值进行识别时，只识别了一个样品的一部分，而其他样品均没有被识别到。这时，眼尖的小编一下子就看出了问题（实际是，自己挖的坑，必须自己填）。

 首先，样品距边界过近。

此时，要降低Air border dilate的值。

于是，完整识别到第一个样品。

——问题来了，为什么第三个样品反倒一点都没有识别上呢？

——Good Question！！！（实际上，是在自问自答） 这是由于样本过于修长，长宽比超过了默认的Max elongation值。

增加Max elongation值以后，就可以全部识别上啦。

还有一个问题就是，第二个样品好像从来都没有被识别上，这是由于样品太小了，所以我们需要将Min region size的阈值降低。

这样，就完美无瑕了！！！是不是超级简单！！！

O(∩_∩)O哈哈~~，大爱Axio Scan. Z1高端大气上档次，低调奢华有内涵！！！

喜欢的小盆友们就约起来吧，我们就在这里等着你~~~